數位曾在蘋果工作的員工表示，在喬布斯去世之后，蘋果內部并不清楚頂層失去了強有力的聲音，這種分權化的架構能否生存下來。在起初的幾個月時間里，沒有人清晰的發號施令做出重大決策，各個團隊間都在相互爭奪地盤。
庫克決定性的時刻出現在擔任蘋果首席執行官第一年的年尾，當時他解雇了斯科特?福斯特（Scott Forstall），他是喬布斯信賴的高管之一。福斯特此前曾負責iPad和iPhone的軟件開發工作；他同時還負責著表現不佳的蘋果地圖和Siri語音助手服務。
當宣布辭退福斯特的消息時，蘋果辦公樓內曾一度鴉雀無聲，連人們的呼吸都能聽得到。庫克隨即又召開高層會議，向他們解釋了新企業結構。蘋果設計主管喬納森?艾維（Jonathan Ive），被委任負責iOS操作系統的界面外觀；而iOS的開發工作則與Mac軟件進行整合，由蘋果軟件開發高級副總裁克雷格?費德里吉（Craig Federighi）負責。
這一計劃的目的是為了打破隔閡，清除內斗，精確執行。庫克表示，對于福斯特的離職，他沒什么要說的，也不會感到遺憾。
內部協作
十年前，當現年53歲的庫克首次成為公眾人物時，他主要以喬布斯助手的身份亮相，給人冷冰冰的感覺。不過在私下里，庫克卻并非如此。他與下屬打成一片，在園區里碰到合影的請求從不推脫，而且會耐心回答任何問題，甚至不惜因此打亂自己的既定計劃。他同樣也會因一些關心的話題而情緒化，無論是奧本大學（庫克的母校）的橄欖球隊，還是社會公正問題。可以推論出，庫克作為蘋果首席執行官的風度，已經注入滲入到蘋果的企業氣質當中。但這似乎太低估了庫克。
協作可能是優點，不過庫克堅持認為，它更是戰略需求。他說，“由于軟件、硬件和服務之間的界限已經混淆或是消失”，對數以千計的員工進行重新調整在當前已至關重要。“唯一能夠成功的途徑，便是所有人都緊密的攜手共事。這并不是說在一起愉快的工作，而是緊密的進行協作，只有這樣他們才能夠專注于偉大的體驗。”
這種結果如今僅僅是體現在不同蘋果設備中運行的服務上。在iPhone 6、新款iOS 8操作系統和Mac OS X Yosemite操作系統上嵌入了一個名為“Continuity”的功能。當用戶在Mac上編寫電子郵件或執行其它任務時，能夠把任務轉移至iPad甚至是Apple Watch。
“在舊模式下，我們絕不可能實現這一點，”庫克表示。這些新產品提醒著“我們在蘋果應當完成的事情，是其他人無法完成的。”